明朝内阁与清朝军机处的差异犹如天地之别宛若春秋笔下的英雄梦
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翰林作为皇帝的顾问和秘书，来自唐高宗时期。明朝时，废除宰相制，朱棣以几名翰林入值文渊阁参预机务，内阁制度开始出现。内阁不同于宰相，不仅不统驭六部，而且受制于内监。
对此，《紫禁城杂志》中有学者张飞燕在《明朝的内阁和清朝的军机处》一文中进行了详细论述。在故宫，一开始成立的内阁实际上是翰林院的一个分支机构，即“东角门内”、“奉天门内”的特殊职责机构。当宣德年间宣宗命阁臣代为批答部分奏章后，他们开始独立批答，并将办公地点由御前转移到文渊阁。此举意味着从临时性设施转变为永久性机构，同时也反映了其从皇帝侍从幕僚到中枢机关的地位提升。但这同时也为宦官擅权创造了条件，因为他们掌握“照阁票批朱”权力。
清朝入关后恢复了明代的这一制度，但规模庞大，有288人正规编制。这时候的一般事务仍然由中央处理，而重要和机密的事务则由议政王大臣会议办理。康熙新政之后，由于皇帝直接处理各项政务，因此需要一个专门负责机要秘书的地方——军机处，这就逐渐取代了原本处理日常事务的大型辅政机关——中央政府中的职能。
雍正时期建立军机处，并设在隆宗门内部，以便更快速、更加私密地办事。而这个位置紧邻乾清宫，使得皇帝能够随时召见军机大臣。在这里，大臣们可以接收并执行最高指示，而太监不得参与其中，更不能进入值房。而对于其他官员来说，只有得到特旨才能进入，没有特旨的人连帘前窗外都不许靠近。
总而言之，在工作流程上，最大的区别在于：明朝的是通过太监朱批，有时候甚至让太监共掌朝政；而清 朝则是设置了一种非常严格、封闭、高度集中化的决策体系，以防止宦官专权，同时确保皇权控制所有重大决策过程。不过，这种系统虽然适合维护稳定，却无法应对创新和全球变化所带来的挑战，如同慈禧太后的时代那样，最终导致帝国衰败。
