明朝人物列表及简介靖难之役的自然序幕
朱棣登基之日，燕军入南京后，他在皇宫中放火，这一举动至今仍是谜团。据说马皇后被指认为朱允炆并被哭泣着称为“傻小子”，其后六月二十日以天子的礼仪安葬了朱允炆，造成建文帝已逝世的假象。而关于建文帝的下落，一直成为千古之谜。据传郑和下西洋之一原因就是为了寻找建文帝的踪迹，而胡濙则私访江浙一带。
朱棣进入南京之后，被翰林院编修杨荣迎接，并询问是否先祭祀陵墓或即位。次日，诸王及文武群臣多次上表劝进，但朱棣未予考虑。在数日后（六月十七），他谒孝陵，并于当天即皇帝位，是为明太宗（改名成祖）。重建奉天殿、刻玉玺等事宜也随之进行。
对于建文年号，朱棣不予承认，将其元、二、三、四年改为洪武三十二至三十五年，然后更改为永乐元年。此外，他还恢复了靖难初期因离间被贬官员的职务，如吴高；取消了建文期间的一些改革措施；废除了与太祖相悖的法律规定。但一些对民众有利的法规也随之废除，如减轻田赋政策。
诛杀前臣
在靖难之役获胜后，朱棣向京城发布公告：“固守封地藩王，因左班奸臣挑唁骨肉被残害，所以不得不起兵诛杀他们，以此来扶持江山社稷和保安亲藩。今拟定的京城奸臣，有罪者不敢赦免，无罪者不敢诛杀，如若误伤受到牵连又祸及到伤亡，不是靖难本意。”
六月二十五日，朱棣诛杀齐泰、黄子澄、方孝孺及其家族。其中方孝孺受牵连而死者的数量达873人，其它犯错者也有千余人。这场屠戮震惊了整个朝廷，对方家的许多亲属朋友都遭受牵连，其中包括方孝孺门生友人的灭族事件，被称作“瓜蔓抄”。
此外，还有许多其他旧臣如卓敬、暴昭等，也因为忠心耿耿而惨死，他们家属亲人同样遭遇悲剧。而直至明仁宗时，大部分流放人员才获得赦免，只留下几个人身后的遗孤始得释放。在大规模屠戮之后，当月还将魏国公徐辉祖关入狱并削爵，但最终释放他。他去世后，其子嗣魏国公爵位没有变更。
铁铉惨案中的铁弦答应割鼻耳塞入口中且无怨言，因为他认为忠诚正义的人类肉体有什么值得犹豫的地方？这导致他的凌迟灭族事件成为历史上的一个著名例证。不过，这个故事并不见于正史，而是在野史中流传开来的另一种版本提到了这一点：当面对如此残忍处罚时，即使再痛苦也不愿透露任何秘密，因此铁弦回答说：“即使要我十族，我也不怕。”但是这只是另一种描述方式，在不同的记载中，每个细节都不尽相同。
